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Antecedentes: O sucesso a longo prazo dos programas não cirúrgicos de redução de peso é variável; portanto, os preditores de resultados são de grande interesse. Nossa hipótese é que a microbiota intestinal conhecida por estar ligada à dieta e à obesidade contenha tais elementos preditivos. Métodos: A análise do metagenoma por sequenciamento shotgun de DNA de fezes foi realizada em uma coorte de 15 adultos com obesidade (índice de massa corporal médio 43,1 kg/m2) que foram submetidos a um programa multidisciplinar de perda de peso de um ano e mais um ano de acompanhamento. Oito indivíduos tiveram sucesso persistente (perda de peso relativa média de 18,2%) e sete indivíduos não tiveram sucesso (0,2%). A relação entre abundâncias relativas de gêneros/espécies bacterianas e mudanças na perda relativa de peso ou índice de massa corporal foi estudada usando três métodos diferentes de modelagem estatística. Resultados: Ao combinar as variáveis ​​preditoras selecionadas pela modelagem estatística aplicada, identificamos sete gêneros bacterianos e oito espécies bacterianas como candidatos para prever o sucesso da perda de peso. Pela classificação das previsões relativas de perda de peso para cada paciente usando modelos de 2 a 5 termos, 13 ou 14 dos 15 indivíduos foram previstos corretamente. Conclusões: Nossos dados sugerem fortemente que os padrões da microbiota intestinal permitem a previsão individual do sucesso da perda de peso a longo prazo. A precisão da previsão parece ser alta, mas precisa de confirmação por estudos prospectivos maiores.