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A desregulação do tecido adiposo (TA) é um processo chave na fisiopatologia da obesidade e das suas complicações cardiometabólicas, mas mesmo que um crescente corpo de evidências tenha sido recolhido nas últimas décadas, a base molecular subjacente da adiposopatia continua por ser totalmente compreendida. Neste contexto, as mitocôndrias, as organelas intracelulares que orquestram a produção de energia e passam por mudanças adaptativas altamente dinâmicas em resposta a ambientes em mudança, emergiram como reguladores cruciais do metabolismo e da função do tecido adiposo branco (WAT) e marrom (BAT). Dado que a microbiota intestinal e seus metabólitos são capazes de regular o metabolismo do hospedeiro, a adipogênese, a inflamação do TAB e a termogênese, levantamos a hipótese de que sua desregulação frequentemente observada na obesidade poderia afetar o metabolismo do AT, exercendo efeitos diretos e indiretos nas mitocôndrias do AT. Ao coletar e revisar as evidências atuais sobre as conexões entre a microbiota intestinal e as mitocôndrias AT na obesidade, obtivemos insights sobre a biologia molecular de seu crosstalk até então inexplorado, rastreando como a microbiota intestinal pode regular a função mitocondrial AT.