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A terapia com células-tronco mesenquimais (MSC) é uma estratégia de tratamento emergente para neutralizar síndromes metabólicas, incluindo obesidade e seus distúrbios comórbidos. No entanto, a sua eficácia é desafiada por vários fatores no ambiente obeso que impactam negativamente a sobrevivência e a função das MSC. A identificação destes fatores prejudiciais proporcionará oportunidades para otimizar a terapia com MSC para o tratamento da obesidade e suas comorbidades. Postula-se que a produção desregulada de adipocinas, um grupo de citocinas e hormônios derivados do tecido adiposo, desempenha um papel fundamental no desenvolvimento de complicações associadas à obesidade. Curiosamente, as adipocinas também foram implicadas na modulação da viabilidade, auto-renovação, proliferação e outras propriedades das CTM. No entanto, o envolvimento do desequilíbrio das adipocinas na funcionalidade prejudicada das CTM não foi completamente compreendido. Por outro lado, o tratamento de indivíduos obesos com CTM pode restaurar o perfil sérico de adipocinas, sugerindo a bidirecionalidade da relação adipocina-CTM. Nesta revisão, pretendemos discutir o conhecimento atual sobre o papel central das adipocinas no crosstalk entre obesidade e disfunção das CTM. Também resumimos os avanços recentes no uso de CTM para o tratamento de doenças associadas à obesidade para apoiar a hipótese de que as adipocinas modulam os benefícios da terapia com CTM em pacientes obesos.