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O objetivo deste estudo foi comparar os efeitos do Treinamento Intervalado de Alta Intensidade (HIIT) e do Treinamento Contínuo de Intensidade Moderada (MICT) no peso, composição corporal, indicadores de lipídios no sangue e estado metabólico em estudantes universitários que vivem com obesidade. O estudo se concentrou em uma amostra de 40 estudantes universitários que vivem com obesidade, incluindo 20 homens e 20 mulheres, com idades entre 18 e 25 anos. Os participantes foram aleatoriamente designados para o grupo HIIT ou o grupo MICT. Ambos os grupos passaram por uma intervenção de 8 semanas, consistindo em três sessões por semana com treinamento em dias alternados. O treinamento do grupo MICT consistiu em exercícios aeróbicos contínuos por 35 minutos a 60–70% da frequência cardíaca máxima. O grupo HIIT se envolveu em 28 min de exercícios alternados de alta e baixa intensidade, onde a fase de alta intensidade foi de 85–90% da frequência cardíaca máxima por 4 min, seguida por um período de recuperação de 3 min a 50–60% da frequência cardíaca máxima, repetido quatro vezes. Ambos os grupos foram submetidos ao monitoramento da frequência cardíaca antes e depois das sessões de treinamento para garantir a precisão da intensidade do treinamento. Dentro de cada grupo, outras distinções foram feitas com base no gênero, resultando nos seguintes subgrupos: grupo HIIT masculino (n = 10), grupo HIIT feminino (n = 10), grupo MICT masculino (n = 10) e grupo MICT feminino (n = 10). As diferenças nos indicadores antropométricos e bioquímicos entre os grupos foram analisadas, e os diferentes efeitos das duas estratégias de intervenção na população de estudantes universitários obesos foram avaliados de forma abrangente. Comparado à avaliação inicial, o grupo HIIT mostrou uma tendência de declínio mais favorável do que o grupo MICT em termos de morfologia corporal e composição corporal, particularmente no aspecto da porcentagem de gordura corporal (GC%). O grupo HIIT masculino, o grupo HIIT feminino, o grupo MICT masculino e o grupo MICT feminino reduziram respectivamente em − 23,71%, − 26,76%, − 9,81%, − 7,16%. O grupo HIIT masculino e feminino experimentou uma diminuição mais pronunciada em comparação ao grupo MICT, com o grupo HIIT feminino reduzindo 3,75% a mais do que o grupo HIIT masculino. Em relação às diferenças intergrupais, diferenças significativas de GC% foram mostradas entre o grupo MICT masculino e o grupo HIIT (P < 0,05), e o grupo MICT feminino e o grupo HIIT (P < 0,01). Em termos de indicadores bioquímicos, o grupo HIIT também apresentou uma tendência de declínio mais favorável em comparação ao grupo MICT, com os participantes masculinos do HIIT mostrando mais redução do que as participantes femininas do HIIT, especialmente no colesterol total (CT) (10,64%), colesterol de lipoproteína de baixa densidade (LDL-C) (11,73%), alanina aminotransferase (ALT) (11,99%) e ácido úrico (AU) (11,76%). Em relação aos triglicerídeos (TG), diferenças intergrupais significativas foram observadas entre os grupos masculinos MICT e HIIT (P < 0,01) e os grupos femininos MICT e HIIT (P < 0,01). Em relação à ALT, uma diferença significativa foi mostrada entre os grupos femininos MICT e HIIT (P < 0,01), enquanto nenhuma diferença significativa foi observada entre os participantes masculinos. No geral, para estudantes universitários que vivem com obesidade, tanto o HIIT quanto o MICT mostraram efeitos positivos. Entre estes, o HIIT demonstra maior eficácia em comparação ao MICT em BF% e marcadores bioquímicos.