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A coexistência dos seres humanos e da microbiota intestinal começou há milhões de anos. Até agora, desenvolveu-se gradualmente um equilíbrio entre as bactérias intestinais e os seus hospedeiros. É agora reconhecido que a microbiota intestinal é fundamental para formar funções imunológicas e metabólicas adequadas e, mais em geral, para a manutenção de uma boa saúde. A microbiota intestinal é estabelecida antes do nascimento sob a influência da nutrição materna e do estado metabólico, o que pode impactar o risco metabólico futuro da prole em termos de obesidade, diabetes e distúrbios cardiometabólicos durante a vida. A obesidade e a diabetes são propensas a perturbar a microbiota intestinal e alterar a permeabilidade da barreira intestinal, levando à endotoxemia metabólica com consequências prejudiciais para a saúde. Sequências bacterianas específicas são agora vistas como assinaturas peculiares da síndrome metabólica ao longo dos estágios da vida de cada indivíduo e estão ligadas à patogênese de doenças cardiovasculares (DCV) por meio de produtos metabólicos (metabólitos) e modulação imunológica. Esses mecanismos têm sido associados, em associação com anormalidades na riqueza e diversidade microbiana, a um risco aumentado de desenvolvimento de hipertensão arterial, inflamação sistêmica, doença hepática gordurosa não alcoólica, doença arterial coronariana, doença renal crônica e insuficiência cardíaca. Estratégias emergentes para a manipulação da microbiota intestinal representam uma opção terapêutica promissora para a prevenção e tratamento de DCV, especialmente em indivíduos propensos a eventos cardiovasculares.