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São necessárias mais investigações para definir o impacto do confinamento pandémico a longo prazo nas crianças. Examinar as mudanças no escore z do índice de massa corporal (zIMC), estilo de vida, qualidade de vida relacionada à saúde e proporção de sobrepeso ou obesidade (SP/OB) em crianças de 6 a 9 anos de idade na Argentina. Estudo observacional com medições iniciais antes do confinamento e acompanhamento após oito meses de medidas restritivas rigorosas (novembro de 2020, primeira visita, n = 144) e após dez meses de reabertura parcial (setembro de 2021, segunda visita, n = 108). As alterações antropométricas desde o início até a primeira visita no grupo de confinamento (GL) foram comparadas com um grupo de controle histórico (HCG, n = 134). As visitas de acompanhamento incluíram medidas antropométricas, questionário de estilo de vida e Inventário Pediátrico de Qualidade de Vida. A alteração no zIMC foi maior em LG [mediana, IIQ: 0,46 (-0,00; 0,83)] vs HCG [mediana, IIQ: 0,02 (-0,31; 0,27)]; p < 0,001, principalmente em crianças com EP/OB pré-existentes. No LG, o zIMC foi maior na primeira e na segunda consulta em relação ao valor basal (p < 0,001) e na segunda consulta em relação à primeira consulta para os meninos (p = 0,037), mas não para as meninas. A proporção de crianças com EP/OB aumentou desde o início (43,5%) até a primeira (56,5%) e segunda consulta (58,3%) (p = 0,029). Ao contrário das meninas, a proporção de meninos com EP/OB aumentou desde o início até a primeira e segunda consulta (p = 0,045). A alteração no zIMC foi maior em crianças com hábitos menos saudáveis ​​(p < 0,001). O ganho de peso continuou a aumentar nos rapazes quando as medidas de confinamento foram facilitadas, embora os comportamentos sedentários tenham diminuído e a qualidade de vida melhorado, indicando que os efeitos do confinamento pandémico poderiam ser difíceis de reverter.