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A obesidade tem efeitos negativos nas comorbidades, na qualidade de vida relacionada à saúde e na sobrevivência. Foram relatadas alterações no comprimento dos telômeros (TL) após a cirurgia bariátrica, mas os estudos são contraditórios e as análises que utilizam técnicas de última geração para medição de TL, como o flow-FISH, são escassas. Medimos a dinâmica dos TL via flow-FISH em pacientes submetidos à cirurgia bariátrica e comparamos seus TL com 105 indivíduos saudáveis. Foram incluídos pacientes com obesidade submetidos à cirurgia bariátrica. Os TL absolutos de linfócitos e granulócitos e ajustados por idade (aa) foram analisados ​​por flow-FISH antes (coorte pré-operatória, n = 45) e após a cirurgia (coorte de acompanhamento, n = 35) no mês 5,5 ± 3,9 (média ± desvio padrão [SD]). O aaTL inicial de linfócitos foi significativamente menor (-0,37 kb ± 0,18 kb, P = 0,045) em pacientes com obesidade, enquanto o aaTL de granulócitos não foi diferente daquele na população de comparação saudável (0,28 kb ± 0,17 kb, P = 0,11). A dinâmica dos telômeros após a cirurgia mostrou um aumento na média de TL tanto em linfócitos quanto em granulócitos de pacientes com perda pronunciada de IMC ≥ 10 kg/m2. Não encontramos associação entre aumento de LT após a cirurgia e idade, sexo ou tipo de procedimento selecionado para cirurgia bariátrica. Confirmamos que pacientes que sofrem de obesidade apresentam TL de linfócitos significativamente mais curtos usando flow-FISH. Juntamente e dependendo do grau de redução de peso após a cirurgia bariátrica, o TL aumentou significativamente tanto em linfócitos quanto em granulócitos após uma média de 5,5 meses. Nossos resultados mostram que a cirurgia bariátrica afeta não apenas o peso corporal, mas também biomarcadores do envelhecimento, como o TL.