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As pesquisas sobre o impacto da variabilidade sazonal e climática no estado nutricional infantil na Amazônia são limitadas. Examinámos como o estado nutricional das crianças Shawi com menos de cinco anos mudou sazonalmente e explorámos a participação dos pais nas actividades do sistema alimentar (pesca, pecuária, agricultura, caça) como uma influência potencial. Utilizando uma abordagem de investigação comunitária com Povos Indígenas Shawi, realizámos inquéritos transversais nas épocas de pré-colheita (Julho-Agosto de 2014) e pós-colheita (Novembro-Dezembro de 2015). Foram coletados dados sociodemográficos, participação dos pais, peso, altura e concentração de hemoglobina para avaliação nutricional infantil. Empregamos regressão linear bivariável para analisar associações entre variações sazonais na nutrição infantil e envolvimento dos pais no sistema alimentar. O estudo ocorreu em onze comunidades indígenas Shawi em Loreto, Amazônia peruana. No total, foram analisadas 74 crianças Shawi e seus pais. Os resultados indicaram uma diminuição na desnutrição infantil (4,9% para 0,0%) e na anemia persistente (66,2% para 66,2%), enquanto o atraso no crescimento aumentou (39,2% para 41,9%) da pré-colheita para a pós-colheita. A participação dos pais nas atividades alimentares variou sazonalmente, mas o seu impacto no estado nutricional infantil não foi estatisticamente significativo. Nossas descobertas destacam níveis significativos de desnutrição em crianças indígenas Shawi, com ligeira variação sazonal. As futuras intervenções devem considerar a dinâmica sazonal, e é necessária uma maior exploração dos papéis parentais na dieta das crianças.