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Nem todos os indivíduos com obesidade desenvolvem complicações metabólicas, o que originou os conceitos de obesidade metabolicamente saudável e não saudável (MHO/MUO). No entanto, definições inconsistentes destas condições limitaram a sua compreensão. Avaliamos se uma definição de consenso proposta recentemente para MHO/MUO se correlaciona com a adiposidade e reflete parâmetros de risco metabólico durante a puberdade. Foram incluídas crianças de renda média-baixa do Estudo de Coorte de Crescimento e Obesidade (Santiago, Chile) (n = 949; 1.692 consultas no Tanner (T)2, T4 e/ou um ano após a menarca (1YPM)). Antropometria, composição corporal e parâmetros metabólicos foram comparados entre MUO e MHO, e também em crianças sem obesidade. O risco de apresentar fenótipo MUO foi significativamente elevado com maior relação cintura-estatura (T2), zIMC (T2, T4), gordura no tronco e proteína C reativa (T4). Índices cardiometabólicos elevados foram importantes preditores da alocação de fenótipos “não saudáveis” em crianças com ou sem obesidade. Nossas observações sugerem que a definição de consenso em crianças em T2, T4 e 1YPM reflete risco metabólico e obesidade central. A alocação do fenótipo de saúde metabólica por esta equação permite a fácil detecção de fatores de risco que exigem ações para prevenir distúrbios metabólicos a longo prazo em crianças com obesidade e, mais importante, também naquelas sem obesidade.