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Prevista para impactar 310 milhões de crianças na próxima década, a obesidade infantil está ligada a sérios problemas de saúde, como distúrbios metabólicos e doenças cardiovasculares. Este estudo apresenta uma nova abordagem para a avaliação integrada de distúrbios inflamatórios, glicêmicos e lipídicos em crianças obesas em ambientes com recursos limitados e também identifica os principais fatores que contribuem para essas mudanças. Conduzindo uma análise transversal de 231 crianças de 5 a 12 anos de escolas públicas na região semiárida do Brasil, a pesquisa envolveu a coleta de histórico médico, medidas antropométricas e amostras de sangue para analisar perfis glicêmicos e lipídicos, juntamente com níveis de proteína C-reativa. Usamos um modelo adaptado do Grau Molecular de Perturbação para analisar desvios em marcadores metabólicos de um grupo de controle saudável. As análises estatísticas incluíram testes exatos de Mann-Whitney e Fisher, regressão logística regressiva e análise de cluster hierárquico. O estudo identificou uma associação direta e independente entre o Grau de Distúrbio Metabólico elevado e sobrepeso e obesidade em crianças, com diferenças significativas nos níveis de PCR, triglicerídeos e HDL observadas entre os grupos obesos e de peso saudável. As descobertas destacam a necessidade crítica de detecção precoce e compreensão abrangente das mudanças relacionadas à obesidade para mitigar os riscos graves à saúde associados à obesidade infantil.