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Durante a perimenopausa, o aumento do hormônio folículo estimulante (FSH) sérico está associado ao aumento da adiposidade, resistência à insulina (RI) e síndrome metabólica (SM). No entanto, os dados relativos ao período puberal, que se caracteriza pelo aumento dos níveis de FSH e pela alteração da composição corporal, são limitados. Investigar as relações entre FSH e alterações antropométricas, marcadores de RI e desenvolvimento de SM no período peripuberal. O Estudo Longitudinal de Obesidade Infantil de Uppsala (ULSCO) é um estudo em andamento que visa compreender os fatores que contribuem para a obesidade infantil e o desenvolvimento de doenças relacionadas à obesidade. Analisamos o subconjunto de participantes pré-púberes na primeira consulta (n = 95, 77 com obesidade). O tempo médio de seguimento foi de 3,0 ± 1,4 anos. Níveis séricos mais elevados de FSH na primeira consulta foram associados a uma maior probabilidade de elevação no índice de massa corporal (IMC SDS) (p = 0,025, OR = 16,10) e com SM (p = 0,044, OR = 4,67) no acompanhamento . Observamos relações não lineares entre os vários níveis séricos de FSH e marcadores de adiposidade e RI, especialmente em meninas. Na primeira consulta, quando as meninas eram pré-púberes, o FSH estava associado negativamente ao IMC (β = −0,491, p = 0,005) e positivamente associado à globulina ligadora de hormônios sexuais (SHBG) (β = 0,625, p = 0,002). Com a progressão da puberdade, as associações negativas entre IMC e SHBG desapareceram, enquanto o FSH tornou-se positivamente associado ao HOMA-IR (β = 0,678, p = 0,025) e à insulina de jejum (β = 0,668, p = 0,027). Níveis séricos mais elevados de FSH em crianças pré-púberes foram associados a um risco aumentado de desenvolvimento de SM durante a transição puberal. Juntamente com associações não lineares entre os vários níveis séricos de FSH e marcadores de RI, nossos resultados podem implicar uma relação entre FSH e RI da puberdade.